La chiesa di San Francesco d’Assisi secondo la tradizione popolare ricorda il passaggio da Oria del santo d’Assisi. L’attuale costruzione è di periodo barocco, coeva della cattedrale. In origine doveva essere una chiesetta basiliana, dedicata alla Madonna di Costantinopoli.

Intorno al 1219 nei pressi di quella chiesetta basiliana fu fondato un cenobio dallo stesso san Francesco d’Assisi, di ritorno dalla Palestina.

Nel XV secolo la chiesa, con l’annesso convento francescano, venne ricostruita dal principe Giovanni Antonio Del Balzo Orsini, per poi essere nuovamente rifatta nel XVIII secolo.

All’interno si conservano le reliquie del beato Francesco da Durazzo (antico protettore di Oria che si festeggiava nella domenica in Albis) ed una Pietà litica del XV secolo che era conservata nella chiesetta rupestre della Madonna di Gallana. Sul fianco della chiesa si trova il cenotafio del principe Giovanni Antonio Del Balzo Orsini, che edificò la chiesa quattrocentesca (prima dell’attuale barocca). Ospita il Premio Letterario Internazionale ‘Il Pozzo e l’Arancio’, nato nel 2005. Fu eretta parrocchia il 22 agosto 1947 dall’amministratore apostolico Ferdinando Bernardi. È stata ristrutturata negli  anni cinquanta e nel 2004-2005, quando sono stati riportati alla luce resti della chiesa quattrocentesca.